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谷子所分子育种团队在谷子基因定位与基因组研究中取得新进展
发布时间:2017-11-01     文章来源:管理员    浏览:

谷子是农作物研究的主要模式作物之一,开展谷子农艺性状基因定位研究,是解析谷子农艺性状分子遗传机理的关键步骤之一,其研究成果对于其它农作物相关研究也具有重要借鉴意义。

谷子所谷子分子育种团队利用F2群体,采用RAD-Seq测序技术构建了一张包含9,968个SNP标记总长为1648.8 cM的遗传图谱,并定位了 与谷子8个农艺性状相关的QTL位点11个,其中9个为新位点。进一步利用SNP开发了5个与第二节间长、主穗长和主穗粗等性状紧密连锁的分子标记。该部分结果于2017年6月23日在线发表在国际SCI杂志《PLoS ONE》(2016 IF=2.806,https://doi.org/10.1371/journal.pone.0179717,12(6):e0179717)。团队王军博士为通讯作者。

该团队与华大合作,利用F2群体,采用RAD-Seq测序技术完成了一张包含1,694个Bin标记总长为1542.87 cM的遗传图谱,定位了一个与谷子米色相关的基因(Sihc1),该位点可解释80.26%表型变异。进一步通过生物信息学方法和基因克隆手段,预测到4个重要候选基因。该部分结果于2017年9月22日在线发表在国际SCI杂志《Mol Breeding》(2016 IF= 2.47,DOI: 10.1007/s11032-017-0727-4)。团队王军博士为第一通讯作者、华大邹洪锋博士为共同通讯作者。

上述研究得到了山西省农业科学院自主创新能力提升工程项目(2015ZZCX-09, 2016ZZCX-09,2017ZZCX-09),山西省青年基金面上项目(201601D202083,2015021143),山西省农业科学院农业科技创新研究项目(ZDSYS1504),深圳市基础研究政府资助项目(JCY20150831201123287)和国家谷子现代农业产业技术体系(CRRS-07)等项目资助。

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